Недалекое
будущее. Политическая обстановка в мире накалена до предела из-за
крайне неприятного инцидента: в небе над Восточной Европой американской
ракетой был сбит авиалайнер, совершавший коммерческий рейс. В результате
катастрофы все находившиеся на борту погибли. Правительство США
официально заявило о непричастности к произошедшему. Одному из самых
опытных агентов американских спецслужб Майклу Тортону поручено задание
провести расследование и отыскать виновников трагедии, чтобы
предотвратить назревающий международный конфликт. В проекте
Alpha Protocol игрок получает возможность не только полностью
контролировать действия и поведение главного героя, но и определять его
отношение к происходящему, что повлияет на развитие событий.
Реализованная в игре современная боевая система рассчитана на быстрое
принятие решений. Эти интересные особенности в бестгеймер нет  совокупности с
возможностью интенсивного развития героя и инновационными ролевыми
элементами, тщательно продуманным сюжетом, который может соперничать с
лучшими произведениями в жанре шпионского боевика, а также детально
проработанным виртуальным миром, где обеспечивается полный эффект
присутствия, позволяет назвать Alpha Protocol ролевой игрой нового
поколения.